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フラッグシップ株式会社

  • Shopify Plusによる大規模ECサイトのリニューアルや基幹システム連携を検討している企業なら
フラッグシップ株式会社の公式サイトキャプチャ
引用元:フラッグシップ株式会社公式サイト
https://flagship.inc/

フラッグシップ株式会社(Flagship Inc.)は、Shopify Platinum Partnerに認定されている、大規模ECサイトのリニューアル・システム開発・運用支援を得意とする企業です。

Shopifyストアの構築・実装実績は100件以上にのぼり、年商100億円超規模のECサイトを手掛けた実績もあります。また、2024年にはShopify Japanの「Enterprise Partner of the Year」を受賞しています。

このページでは、フラッグシップ株式会社の特徴や実績、構築費用・納期、どのような企業に向いているかを紹介します。

※本ページは2026年11月11日時点で確認した公式情報およびフラッグシップ株式会社から提供された情報を基に作成しています。実績数・サービス内容などは変更される場合があるため、最新情報は公式サイトをご確認ください。

3秒でわかる!フラッグシップ株式会社

得意領域 Shopify Plusを活用した大規模ECサイトのリニューアル・移行・システム連携、エンタープライズECの開発・運用支援
パートナーTier Shopify Platinum Partner
受賞歴 Shopify Partner of the Year 2024 - Japan「Enterprise Partner of the Year」受賞
構築・実装実績 国内最多規模の100件以上。年商100億円超規模のShopifyストア構築・実装実績あり
対応範囲 Shopify PlusによるECリニューアル、越境EC構築、基幹システム・物流システム連携、運用支援、マーケットプレイス構築、BtoE(社販)関連プロダクト提供
自社開発アプリ Shopifyアプリの利用事業者4,500社以上(アクティブユーザー件数・同社提供情報)
構築事例 大手音楽会社の公式EC・越境EC構築、大手カジュアルウェアブランドのECリニューアル、ライフスタイル雑貨大手のフルリニューアル

フラッグシップ株式会社の特徴

Shopify Platinum Partner認定と100件以上の構築・実装実績

フラッグシップ株式会社は、Shopifyを活用したエンタープライズECの開発・リニューアルを得意とする企業です。

2018年には日本初のShopify Plus Partnerに認定され、2026年にはShopify Partner Programの最上位Tierである「Shopify Platinum Partner」に認定されました。

また、2024年にはShopify Japanが主催する「Shopify Partner of the Year 2024 - Japan」において、「Enterprise Partner of the Year」を受賞しています。

同賞は、エンタープライズ企業の複雑な大規模プロジェクトにおいて、計画立案から実装、運用までのShopify Plus移行支援で優れた実績を挙げたパートナーを評価するものです。

同社から提供された情報によると、Shopifyストアの構築・実装実績は国内最多規模の100件以上。年商100億円を超える規模のShopifyストアを手掛けた実績もあります。

大規模なECサイトの刷新や、複数システムの連携が必要なプロジェクトについて、技術面・運用面の両方から相談できる点が特徴です。

参照元: Shopify公式パートナーディレクトリ、 Shopify Partner of the Year 2024 - Japan 受賞パートナー発表
※構築・実装件数および年商規模に関する記載は、フラッグシップ株式会社からの提供情報に基づきます。

大規模ECサイトのリニューアルと基幹システム連携に強み

フラッグシップ株式会社が得意とするのは、Shopify Plusを活用した大規模ECサイトのリニューアルや、既存システムからの移行です。

特に、ERP(基幹業務システム)、WMS(倉庫管理システム)、OMS(受注管理システム)など、ECサイトと企業の基幹・物流システムを連携させる開発に対応しています。

大規模ECサイトでは、商品や注文の管理だけでなく、在庫情報の同期、配送処理、会員情報の管理、複数の販売チャネルとの連携など、多くのシステムを組み合わせる必要があります。

同社では、既存の業務フローやシステム構成を踏まえた要件整理から、Shopify Plusへの移行、独自機能の開発、公開後の運用支援まで対応しています。

既存ECシステムの老朽化や複雑化に課題を抱え、将来的な拡張性や運用効率の向上を目指す企業にとって、相談先の候補となるでしょう。

自社開発Shopifyアプリによる業務効率化・機能拡張

フラッグシップ株式会社は、ECサイトの開発・運用支援で培った知見を活かし、Shopifyアプリの自社開発にも取り組んでいます。

同社から提供された情報によると、自社開発Shopifyアプリの利用事業者は4,500社以上です。この数値はアクティブユーザー件数に基づくものです。

自社開発プロダクトには、出荷伝票や配送日時指定、マイページの機能拡張、社内販売(BtoE)、負荷試験など、ECサイトの運用を支援するものがあります。

こうしたアプリや独自開発の技術を活用することで、ECサイトの機能拡張や業務効率化を支援しています。

ただし、利用できるアプリや追加開発の範囲はプロジェクトの要件によって異なるため、具体的な対応内容は事前の確認が必要です。

越境EC・マーケットプレイス・BtoE領域にも対応

フラッグシップ株式会社は、国内向けECサイトの構築・リニューアルだけでなく、越境ECやマーケットプレイスの構築支援にも対応しています。

Shopify Plusによるグローバル展開を見据えたEC基盤の開発に加え、マーケットプレイスプラットフォーム「Mirakl」を活用したシステム構築・連携も手掛けています。

また、企業の従業員向け販売を支援するBtoE(社販)関連プロダクトの提供など、一般消費者向けECに限らない幅広いコマース領域を扱っています。

既存の販売チャネルを拡張したい企業や、複雑な商流・業務システムに対応できるEC基盤を整備したい企業にも適した支援内容といえます。

サイトの本質的な問題点を理解していますか?

Shopifyでのサイト運用をする上で「思った通りに結果が出ない」「成果に繋がらない」なんてことは、どこの会社も大なり小なり抱えている悩みです。

大抵はちょっとした"ボタンのかけ違い"で、結果的に大きな問題に至っていることが多いです。解決するには、まずこのボタンのかけ違いに気が付けるかどうかがポイントで、すべてと言っても過言ではありません。
解決するためには少なからず試行錯誤する事が必要です。自分たちでトライアンドエラーで経験を積み上げても良いですが、的確に本質的な解決をするには、専門家に相談することも選択肢の一つです。

プロのShopify制作会社
・パートナー会社を知る

フラッグシップ株式会社の構築費用と納期

フラッグシップ株式会社は、Shopify Plusを活用した大規模ECサイトのリニューアルや、基幹システム連携・越境EC・複雑なカスタム開発を伴うエンタープライズEC案件を中心に対応しています。

公式サイトでは、こうしたプロジェクトの予算目安を1,000万円以上と案内しています。

ただし、これは一律の構築料金ではなく、同社が中心的に支援するプロジェクトの予算規模を示すものです。実際の費用は要件や開発範囲によって異なります。

構築費用の目安

項目 公式サイトの案内・確認事項
プロジェクト予算 目安は1,000万円以上
主な対象案件 Shopify Plusを用いた大規模ECリニューアル、基幹システム連携、越境EC、複雑なカスタム開発など
具体的な構築費用 要件・目標・スケジュールを確認したうえで個別見積もり
相談から契約まで 初回ヒアリングから契約まで通常2~4週間程度

構築期間の目安

公式サイトによると、標準的なプロジェクトでは、ヒアリングから公開まで最短約3ヶ月の事例があります。

一方、基幹システム連携や段階的な移行、複数の国・地域に対応する構成など、複雑な要件を伴う場合は、数年を要するケースもあると案内されています。

また、公開期限が決まっている場合には、フェーズを分けた段階的なリリースにも対応しています。

そのため、見積もり時には構築費用だけでなく、必要な機能や移行対象、公開希望時期、既存システムとの連携範囲を整理しておくことが重要です。

詳細はフラッグシップ株式会社の公式サービスページをご確認ください。

※費用・納期の情報は2026年11月11日時点の公式サイト掲載情報を基にしています。

フラッグシップ株式会社がおすすめな企業・不向きな企業

フラッグシップ株式会社に依頼すべきケース

  • Shopify Platinum Partnerに、Shopify Plusを活用した大規模ECサイトのリニューアル・移行を依頼したい企業
  • 年商数十億円から100億円超規模のEC事業を運営しており、将来的な拡張性も踏まえてシステムを刷新したい企業
  • ERP・WMS・OMSなどの基幹システムや物流システムとの複雑な連携が必要な企業
  • 国内外でのEC展開や越境EC、マーケットプレイス構築を検討している企業
  • 自社開発Shopifyアプリやカスタムシステムを活用して、業務効率化・機能拡張を進めたい企業
  • 構築だけでなく、公開後の運用やシステム改善まで継続的に相談したい企業

別の会社を検討すべきケース

  • ECサイトの新規立ち上げにあたり、標準テンプレートと基本機能だけで小規模に運用を開始したい企業
  • 数十万円から数百万円程度の予算で、システム連携や独自機能開発を伴わない簡易的なサイト構築を希望する企業
  • 複雑なシステム刷新ではなく、既存ECサイトのデザイン変更など限定的な改修のみを依頼したい企業

フラッグシップ株式会社は、大規模ECサイトのリニューアルや、複雑なシステム連携を伴う開発に強みを持つ企業です。

そのため、単純なサイト制作だけでなく、EC事業全体のシステム構成や運用上の課題を見直したい企業に向いていると考えられます。

一方、初期費用を抑えた小規模なECサイト構築を希望する場合は、予算や要件に適した制作会社と比較検討するとよいでしょう。

条件に合わないと感じた方へ

自社の要件やフェーズに合った最適なパートナー選びが成功の鍵です。フラッグシップ株式会社とは別の強みを持つプロフェッショナルを比較検討したい場合は、以下の厳選リストをご活用ください。

予算や目的に合ったShopify構築支援パートナー3選はこちら

まとめ

フラッグシップ株式会社は、Shopify Platinum Partnerに認定されている、大規模ECサイトのリニューアル・移行・システム開発・運用支援を得意とする企業です。

2024年にはShopify Japanの「Enterprise Partner of the Year」を受賞しており、同社から提供された情報によると、国内最多規模の100件以上のShopifyストア構築・実装実績があります。年商100億円超規模のECサイトを手掛けた実績も特徴です。

また、自社開発Shopifyアプリの利用事業者数は4,500社以上とされており、基幹システム連携や独自機能の開発、越境EC、マーケットプレイス構築など、複雑な要件を伴うEC事業を支援しています。

構築費用は個別見積もりで、主な対象となるエンタープライズEC案件の予算目安は1,000万円以上です。

Shopify Plusを活用して大規模ECサイトを刷新したい企業や、既存のシステム・業務フローを含めて見直したい企業にとって、有力な比較候補の一つとなるでしょう。

当サイトでは、「ShopifyのECサイト構築を外部に委託したいけれど、どこに頼めばいいか分からない……」といった皆さまのために、数ある構築支援パートナーの中からおすすめの会社をご提案しています。

おすすめのShopify制作会社・
構築支援パートナー3選

フラッグシップ株式会社の会社情報

会社名 フラッグシップ株式会社(Flagship Inc.)
設立 2012年7月4日
代表者 代表取締役 神馬 光滋
所在地 〒102-0083 東京都千代田区麹町5-3-23 WeWork日テレ四谷ビル
資本金 1,000万円
事業内容 ECサイトのリニューアル開発・運用支援/マーケットプレイス運営・BtoE(社販)に関わるプロダクト提供
パートナー認定 Shopify Platinum Partner
受賞歴 Enterprise Partner of the Year(Shopify Partner of the Year 2024 - Japan)
認証 ISO/IEC 27001(登録番号 IS 725908)
公式サイト https://flagship.inc/

※会社概要は2026年11月11日時点で確認した公式情報およびフラッグシップ株式会社から提供された情報を基にしています。

フラッグシップ株式会社に関するよくある質問(FAQ)

Q. フラッグシップ株式会社のShopify構築の特徴は?
A. Shopify Platinum Partnerとして、Shopify Plusを活用した大規模ECサイトのリニューアル・移行・システム開発を得意としています。基幹システムや物流システムとの連携、越境EC構築、公開後の運用支援など、エンタープライズECの複雑な要件に対応できる点が特徴です。
Q. Shopifyのパートナー認定や受賞歴はありますか?
A. はい。フラッグシップ株式会社は2026年にShopify Platinum Partnerに認定されています。また、2024年にはShopify Partner of the Year 2024 - Japanにおいて「Enterprise Partner of the Year」を受賞しています。
Q. Shopifyストアの構築・実装実績はどのくらいありますか?
A. フラッグシップ株式会社から提供された情報によると、国内最多規模の100件以上のShopifyストア構築・実装実績があります。年商100億円超規模のShopifyストアを手掛けた実績もあります。
Q. どのような業種・規模のECサイトに対応していますか?
A. 大手音楽会社の公式EC・越境EC構築、大手カジュアルウェアブランドのECリニューアル、ライフスタイル雑貨大手のフルリニューアルなどの実績があります。大規模ECサイトや、複雑な機能開発・システム連携を伴うプロジェクトに対応しています。
Q. 自社開発Shopifyアプリの実績はありますか?
A. はい。出荷伝票・配送日時指定・マイページ拡充・社販などに関連するShopifyアプリを開発しています。同社から提供された情報によると、自社開発Shopifyアプリの利用事業者は4,500社以上(アクティブユーザー件数)です。
Q. 構築費用と納期の目安はどのくらいですか?
A. 公式サイトでは、同社が中心的に支援する大規模EC案件のプロジェクト予算目安を1,000万円以上と案内しています。構築期間は、標準的なプロジェクトで最短約3ヶ月の事例がありますが、複雑な要件ではさらに長期間を要する場合があります。具体的な費用・納期は個別見積もりとなります。
成長フェーズに合わせて選ぶ!
Shopify構築支援
パートナーおすすめ3社!
Shopify Partner Directoryには、日本のパートナー107社が掲載されています(2026年9月29日時点)。
本ページでは、Shopify構築に対応するパートナーの中から、
「BtoB EC・システム連携」「越境EC・海外マーケティング」「構築後のEC運用」という
異なる課題への支援内容を公式情報で確認できる3社をご紹介します。
自社が抱えている課題に合ったパートナーを選びましょう。
あなたの悩み・課題を
解決できるのは?
BtoB ECの要件整理・システム連携
に不安がある企業におすすめ
フルバランス
株式会社フルバランス
引用元HP:株式会社フルバランス公式サイト
https://fbl.jp/
法人取引を前提としたECサイトでは、既存の商流や業務フロー、外部システムとの連携などを踏まえた設計が求められます。
フルバランスは、システム開発をバックグラウンドとした技術力を活かし、BtoB ECをはじめ、大規模・複雑な要件を含むShopify構築や、他カートからの移行、構築後の運用支援まで対応。
Shopify Partner Directoryでは「Platinum Partner」※1として掲載され、2024年には「Shopify Partner of the Year 2024 - Japan」のMarket Expansion Partner of the Yearを受賞※2しています。
要件整理から構築後の成長まで相談したい企業の「BtoB ECグロースパートナー」です。

公式サイトで詳しく見る

越境ECのマーケティングサポートを
お願いしたい企業におすすめ
世界へボカン
世界へボカン株式会社
引用元HP:世界へボカン株式会社公式サイト
https://www.s-bokan.com/
越境ECや海外販路拡大、海外Webマーケティングを専門領域として支援している会社です。Shopify Partner Directoryでは「Select Partner」※3として掲載されています。
海外市場調査や戦略立案から、Shopifyを活用した越境ECサイトの制作・構築、海外SEO、英語リスティング広告、コンテンツマーケティングまで幅広くサポート。
「海外向けのECサイトを作る」だけでなく、その後の集客や売上拡大まで見据えて相談したい企業に適した「越境屋ボーダレスプランナー」です。

公式サイトで詳しく見る

受注・CS・物流までEC運用を
まるっと任せたい企業におすすめ
コマースメディア
株式会社コマースメディア
引用元HP:株式会社コマースメディア公式サイト
https://commerce-media.info/
Shopifyサイトを構築した後の運用体制や社内リソース不足までまとめて相談したい企業に向いています。Shopify Partner Directoryでは「Premier Partner」※4として掲載されています。
サイト構築だけでなく、商品登録、サイト更新、受注対応、在庫管理、OMS連携、カスタマーサポート、物流など、リリース後のEC運用まで幅広く支援。
EC事業の戦略策定から構築、運用・改善まで一気通貫で任せたい企業を支える「便利屋トータルサポーター」です。

公式サイトで詳しく見る

■各社のShopifyパートナー情報
※1 Shopify Partner Directory「株式会社フルバランス」掲載情報より。2026年9月29日時点でPlatinum Partnerとして掲載。
※2 Shopify公式「Shopify Partner of the Year 2024 - Japan」にて、株式会社フルバランスがMarket Expansion Partner of the Yearを受賞。
※3 Shopify Partner Directory「世界へボカン株式会社」掲載情報より。2026年9月29日時点でSelect Partnerとして掲載。
※4 Shopify Partner Directory「コマースメディア株式会社」掲載情報より。2026年9月29日時点でPremier Partnerとして掲載。

■掲載・選定方針
本ページでは、Shopify Partner Directoryに掲載されている企業のうち、以下の条件を満たし、異なる課題・目的への支援内容を公式情報で確認できる3社を紹介しています。(2026年9月29日時点)

  • ①Shopify Partner Directoryに掲載されていること
  • ②Shopifyを活用したECサイトの構築・リニューアル等に対応していること
  • ③各社公式サイトまたはShopify Partner Directoryで、現在の支援内容や対応領域を確認できること
  • ④「BtoB EC・システム連携」「越境EC・海外マーケティング」「構築後のEC運用」のいずれかに明確な強み・対応実績が確認できること
  • ・フルバランス:BtoB EC・複雑な要件への対応 … Shopify Platinum Partner。BtoBを含むEC構築や、他カートからの移行、構築後の運用支援などに対応。2024年にはShopify Partner of the Year 2024 - JapanのMarket Expansion Partner of the Yearを受賞
  • ・世界へボカン:越境EC・海外マーケティング … Shopify Select Partner。Shopifyを活用した越境ECサイト構築に加え、海外市場調査、海外SEO、海外広告、コンテンツマーケティングなど海外販路拡大を幅広く支援
  • ・コマースメディア:EC運用・物流までのトータルサポート … Shopify Premier Partner。サイト構築から商品登録、受注、在庫管理、カスタマーサポート、物流、コンサルティングまでEC事業を一貫して支援

※ShopifyのパートナープログラムおよびPartner Directoryの掲載状況・ティアは変更される場合があります。掲載情報は2026年9月29日時点で、Shopify公式および各社公式サイトにて確認した内容をもとにしています。