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Shopifyでもできる?在庫連携の不安を解決!

Shopifyで構築したECサイトの在庫管理を手間に感じる場合の解決策について紹介します。
時間やスタッフのリソースを削減したい、複数チャネルで在庫を一括で管理したいと考えている方は是非ご覧ください。

ECの在庫管理に関する悩み

ShopifyはECサイトの構築をサポートするサービスですが、標準機能のみの利用だと、商品在庫の増減などを手入力で行わなければいけません。

商品入荷時や他ショップツールとの在庫調整時に修正は必要となりますが、あまり在庫管理に手をかけられない場合は後回しになりがちです。

しかし売れ筋の商品などは入荷後すぐに在庫登録しなければ、在庫があるのに欠品となり、機会損失につながります。

在庫管理の作業を減らしたい、作業時間を確保できないなどの理由で困っている方は在庫管理システムを活用するのがおすすめです。

在庫管理サービスと連携するメリット

在庫管理サービスの利用で得られるメリットは、大きく3つあります。

スタッフが削減できる

在庫を管理するスタッフが不要となり、人員削減や他業務へリソースをまわせます。

他業務と平行して在庫管理業務を担当していた場合には、本来の仕事に集中できます。

リアルタイムで正確な数字を把握できる

複数の販売ルートを含めて数字が確認できるため、全体の状況を正確に把握できます。

別々の売上データでは、数字を参考にした販売戦略がずれてしまいかねません。

実店舗も含めた一括管理が可能

ツールによっては実店舗の在庫も含めて管理が可能となります。

販売方法を複数設置するオムニチャネルにおいては在庫の共有が欠かせません。

Shopifyで利用できるアプリをご紹介

NEXT ENGINE

NEXT ENGINE
引用元:NEXT ENGINE公式サイト
https://next-engine.net/

クリエイティブ分野をサポートするHamee株式会社の在庫管理サービス。

キャンセルや返品などの対応に加えて、イベントやサンプルなどイレギュラーな理由で商品を出品する際にも自動的に対応します。

販売以外の理由で在庫が増減するケースが多いショップにおすすめです。複数のECショップにおいて異なる商品コードが違っていても、連携して自動的に同じ商品として管理してくれます。

LOGILESS

LOGILESS
引用元:LOGILESS公式サイト
https://www.logiless.com/

ECの物流関連業務をサポートする株式会社ロジレスのサービス。

APIを提供しているため、独自のシステムや会計システムとも連動可能。ショップや社内でShopify以外にもさまざまなサービスを利用しているケースに向いています。

料金体系は基本料金の月額22,000円(税込)に加え、1出荷あたり2円〜20円までの従量料金の組み合わせです。

ロジクラ

ロジクラ
引用元:ロジクラ公式サイト
https://logikura.jp/

企業の想いを顧客に届ける物流のサポートを重視している株式会社ロジクラのサービス。

商品100点までの登録及び月50件までの出荷なら、なんと初期費用も含めて無料で利用可能です。

小規模のECサイトで試しに在庫管理サービスを導入してみたいケースにおすすめです。

また、iPhoneによる操作も可能なので、忙しい方も場所を問わず確認できます。

SHIPPINNO

SHIPPINNO
引用元:SHIPPINNO公式サイト
https://www.shippinno.net/

EC向けWebサービスを展開するシッピーノ株式会社が提供する、バックヤード作業代行も一体化されたツール。

Amazonにも負けない発送スピードで、本州への発送なら14時までの注文で翌日に到着します。スピーディーなバックヤード業務も含めたシステムを探しているケースにぴったりです。

無料トライアルシステムも用意されています。

はぴロジ

はぴロジ
引用元:はぴロジ公式サイト
https://www.hapilogi.co.jp/

運営元の株式会社はぴロジは、流通インフラのクラウド型流通統合制御システム「logiec」を提供しています。

複数商品の組み合わせで作るセット商品での発送や、独自梱包材の利用にも対応しています。

商品の組み合わせによる販売戦略や梱包などで、他との差別化を重視しているショップにおすすめです。

Shopify以外にも16種類のECショップツールやモールと連携できるので、Amazonや楽天などでも展開している場合にもおすすめ。

まとめ

Shopifyを導入している、または現在導入しているけれども在庫管理を簡略化したい、という方は、連携できるツールを利用して自動化するのがおすすめです。

せわしない在庫管理業務から解放されるだけでなく、実店舗も含めて一括で管理したデータをリアルタイムにチェックできる場合も。

Shopifyと他アプリの連携を不安に感じる方は、導入が難しいさまざまなアプリとの連携もサポート可能なプロフェッショナルの構築会社に任せれば安心です。

在庫連携に関する相談もお任せの
信頼できるShopify構築支援パートナー3選

成長フェーズに合わせて選ぶ!
Shopify構築支援
パートナーおすすめ3社!
Shopify Partner Directoryには、日本のパートナー107社が掲載されています(2026年9月29日時点)。
本ページでは、Shopify構築に対応するパートナーの中から、
「BtoB EC・システム連携」「越境EC・海外マーケティング」「構築後のEC運用」という
異なる課題への支援内容を公式情報で確認できる3社をご紹介します。
自社が抱えている課題に合ったパートナーを選びましょう。
あなたの悩み・課題を
解決できるのは?
BtoB ECの要件整理・システム連携
に不安がある企業におすすめ
フルバランス
株式会社フルバランス
引用元HP:株式会社フルバランス公式サイト
https://fbl.jp/
法人取引を前提としたECサイトでは、既存の商流や業務フロー、外部システムとの連携などを踏まえた設計が求められます。
フルバランスは、システム開発をバックグラウンドとした技術力を活かし、BtoB ECをはじめ、大規模・複雑な要件を含むShopify構築や、他カートからの移行、構築後の運用支援まで対応。
Shopify Partner Directoryでは「Platinum Partner」※1として掲載され、2024年には「Shopify Partner of the Year 2024 - Japan」のMarket Expansion Partner of the Yearを受賞※2しています。
要件整理から構築後の成長まで相談したい企業の「BtoB ECグロースパートナー」です。

公式サイトで詳しく見る

越境ECのマーケティングサポートを
お願いしたい企業におすすめ
世界へボカン
世界へボカン株式会社
引用元HP:世界へボカン株式会社公式サイト
https://www.s-bokan.com/
越境ECや海外販路拡大、海外Webマーケティングを専門領域として支援している会社です。Shopify Partner Directoryでは「Select Partner」※3として掲載されています。
海外市場調査や戦略立案から、Shopifyを活用した越境ECサイトの制作・構築、海外SEO、英語リスティング広告、コンテンツマーケティングまで幅広くサポート。
「海外向けのECサイトを作る」だけでなく、その後の集客や売上拡大まで見据えて相談したい企業に適した「越境屋ボーダレスプランナー」です。

公式サイトで詳しく見る

受注・CS・物流までEC運用を
まるっと任せたい企業におすすめ
コマースメディア
株式会社コマースメディア
引用元HP:株式会社コマースメディア公式サイト
https://commerce-media.info/
Shopifyサイトを構築した後の運用体制や社内リソース不足までまとめて相談したい企業に向いています。Shopify Partner Directoryでは「Premier Partner」※4として掲載されています。
サイト構築だけでなく、商品登録、サイト更新、受注対応、在庫管理、OMS連携、カスタマーサポート、物流など、リリース後のEC運用まで幅広く支援。
EC事業の戦略策定から構築、運用・改善まで一気通貫で任せたい企業を支える「便利屋トータルサポーター」です。

公式サイトで詳しく見る

■各社のShopifyパートナー情報
※1 Shopify Partner Directory「株式会社フルバランス」掲載情報より。2026年9月29日時点でPlatinum Partnerとして掲載。
※2 Shopify公式「Shopify Partner of the Year 2024 - Japan」にて、株式会社フルバランスがMarket Expansion Partner of the Yearを受賞。
※3 Shopify Partner Directory「世界へボカン株式会社」掲載情報より。2026年9月29日時点でSelect Partnerとして掲載。
※4 Shopify Partner Directory「コマースメディア株式会社」掲載情報より。2026年9月29日時点でPremier Partnerとして掲載。

■掲載・選定方針
本ページでは、Shopify Partner Directoryに掲載されている企業のうち、以下の条件を満たし、異なる課題・目的への支援内容を公式情報で確認できる3社を紹介しています。(2026年9月29日時点)

  • ①Shopify Partner Directoryに掲載されていること
  • ②Shopifyを活用したECサイトの構築・リニューアル等に対応していること
  • ③各社公式サイトまたはShopify Partner Directoryで、現在の支援内容や対応領域を確認できること
  • ④「BtoB EC・システム連携」「越境EC・海外マーケティング」「構築後のEC運用」のいずれかに明確な強み・対応実績が確認できること
  • ・フルバランス:BtoB EC・複雑な要件への対応 … Shopify Platinum Partner。BtoBを含むEC構築や、他カートからの移行、構築後の運用支援などに対応。2024年にはShopify Partner of the Year 2024 - JapanのMarket Expansion Partner of the Yearを受賞
  • ・世界へボカン:越境EC・海外マーケティング … Shopify Select Partner。Shopifyを活用した越境ECサイト構築に加え、海外市場調査、海外SEO、海外広告、コンテンツマーケティングなど海外販路拡大を幅広く支援
  • ・コマースメディア:EC運用・物流までのトータルサポート … Shopify Premier Partner。サイト構築から商品登録、受注、在庫管理、カスタマーサポート、物流、コンサルティングまでEC事業を一貫して支援

※ShopifyのパートナープログラムおよびPartner Directoryの掲載状況・ティアは変更される場合があります。掲載情報は2026年9月29日時点で、Shopify公式および各社公式サイトにて確認した内容をもとにしています。